पौधों में रोगों की शुरुआत और प्रसार को नियंत्रित करने में मदद करने के लिए समय पर किए जाने चाहिए।
फसलों का चक्रण रोगजनक (बीमारी पैदा करने वाले जीव) विशेष पौधों के लिए विशिष्ट होते हैं। एक फसल को दूसरी फसल से बदलने से बीमारी की संभावना कम हो जाती है।
रोगग्रस्त संक्रमित पौधों को उखाड़कर या जलाकर हटा देना चाहिए।
बीज उपचार बुवाई से पहले बीजों को फफूंदनाशकों और कीटनाशकों के तनु घोल से उपचारित करना चाहिए। इससे बीज की सतह पर चिपके रोगाणुओं का सफाया हो जाएगा।
प्राकृतिक तरीके से कीड़ों को मारने के लिए जैविक नियंत्रण मित्र किट और शिकारी कीड़ों को छोड़ा जा सकता है।
उचित खाद जंग जैसे मामलों में नाइट्रोजन उर्वरकों की अधिकता या कमी से पौधों की संवेदनशीलता बढ़ जाती है। इसलिए नाइट्रोजन और फास्फोरस उर्वरकों का संतुलन बनाए रखना आवश्यक है।
रसायनों का प्रयोग कीटनाशकों, फफूंदनाशकों और कीटनाशकों के उपयोग से फसल के नुकसान को कम किया जा सकता है। लेकिन इनका उपयोग सावधानी से करना चाहिए। उन्हें बायोडिग्रेडेबल होना चाहिए।
प्रणालीगत कीटनाशक इन यौगिकों को जब पत्तियों, तनों और कभी-कभी पौधों की जड़ों पर लगाया जाता है, तो सामान्य पोषण के दौरान पौधों में अवशोषित और स्थानांतरित हो जाते हैं। उनकी सांद्रता पौधे के लिए सुरक्षित होती है लेकिन पौधों पर भोजन करने वाले कीड़ों के लिए घातक होती है।
खरपतवार नाशक कृषि भूमि पर चुनिंदा अवांछित वनस्पतियों को नियंत्रित करने के लिए प्रयुक्त हर्बिसाइड्स या तो चुनिंदा रूप से कार्य कर सकते हैं, या फसल के उभरने से पहले उन्हें लागू किया जा सकता है।